Ekstrakcja ultradźwiękowa jest głównie stosowana w przemyśle soków i napojów do ekstrakcji skutecznych składników, takich jak pektyna i pigmenty roślinne. Wibracje ultradźwiękowe mogą przebić się przez ściany komórek roślinnych, umożliwiając pektynie, pigmentom roślinnym i innym składnikom wypływ do soku. Jednocześnie ultradźwięki nadal działają, aby rozproszyć cząsteczki pektyny i pigmentu roślinnego na mniejsze. Te mniejsze cząsteczki mogą być bardziej równomiernie i stabilnie rozprowadzone w soku. Stabilność pektyny ekstrahowanej ultradźwiękowo i rafinowanej jest oczywiście zwiększona. Wstrzyknięcie jej do soków i napojów może zapobiec ich osiadaniu i rozwarstwianiu. Kolor pigmentów roślinnych ekstrahowanych i rafinowanych ultradźwiękami jest bardziej żywy, co może znacznie poprawić kolor soków i napojów.